Делал на кассах с 4 лет до 6 месяцев, по частям 1-1.5 года.
Удаление там может идти доооолго.
Начинается оно после закрытия смены.
На одной особо тормозной кассе чеки за 1.5 года удаляло больше 12 часов.
Чем она занимается - можно смотреть в mysql - show full processlist;
Если есть 'delete from trm_out_.... ' - это оно.

Плюс что-то у меня (46sp2) с очисткой таблиц входа/выхода кассиров нехорошо получилось. На некоторых кассах их порезало почти в 0, а сейчас, блин, разгребаю аналогичный глюк с сервером магазина.

Быстрее будет если кассы не работают.