Вообще, если есть в документе контрагент, у которого на закладке "Собственный контрагент" привязано место хранения, то Супермаг документ с этим контрагентом рассылает в базу данных, к которой привязано это место хранения.
Это описано в документации, это "логичное поведение" Супермага.
В чем суть ошибки?