Уже пару лет пользуюсь программой для записей с древовидной структурой данных Mars NoteBook, для русскоговорящих программа бесплатна, что не может не радовать. Удобный инструмент, пометки/заметки, полезные вырезки из статей помещаю туда. Есть возможность импорта/экспорта, шифрования и прочие фишки. Один минус - под Винду.
Информации накопил уже километр, и не хочется менять коня на переправе, но все-таки: А кто чем еще подобным пользуется, кто что посоветует(Естественно мультиплатформенное), под Винду меня моя полностью устраивает.
Или может её под вином на линухе попробовать запустить и не париться? Просто как-то до этого не испытывал острой необходимости в наличии такого помощника на линухе.