Гигантские количества 0 артикула : Супермаг Плюс (Супермаг 2000)

Я в бухгалтерии не силён, да и в СМ+ вникать только начинаю, по этому мне сложно ответить почему так получилось и живы ли бухгалтера ответственные за это.

Я бы и предложил передать инициативу бухгалтерии, чтобы они приняли решение. В противном случае можно стать крайним в подготовке отчетности.

Я бы вообще предложил начать с новой базы и инвентаризации товара. Даже классификатор не переносил, а заново создал.
Ибо сейчас исходя из вышеописанного с остатками там форменный бардак и любая отчетность будет в варианте: "Два пальца левее Альголя" (с)

Я понимаю, что решение должна принять бухгалтерия, но для начала хотелось бы решить проблему на тестовом сервере и посмотреть, к чему это приведет. В дальнейшем отстаивать свою точку в диалоге с ними.