Что-то мне подсказывает, что при удалении документов :)
У меня нет под рукой свежих версий Супермага. "Журнал удаленных документов" - это отчет?
Сильно подозреваю, что он просто выбирает из таблички истории документов факты удаления.
Конкретно кассовые документы чаще всего не удаляются руками, а пересоздаются кассовым модулем. Обычно его настраивают, чтобы он делал кассовые сразу после загрузки. Если в файлах от касс появляются данные хоть по одной смене, закрытой датой кассового документа - документ удаляется и создается по новой.
Если во входящих файлах от касс при приеме обнаружены ошибки - файлы не удаляются.
То есть запросто может быть, что одни и те же смены раз за разом принимаются и кассовый модуль раз за разом сносит кассовые документы и создает их снова.
Сами по себе отметки в журнале об удалении кассовых сильно беспокоить не должны.
Обычная практика, когда кассы закрываются не одновременно. Первые закрытые кассы могут попасть в один сеанс приема, другие - в последующие. Кассовый тогда может быть пересоздан несколько раз, пока не примутся смены со всех касс.
Лишь бы кассовые были на месте и сходились по суммам с продажами.