Для начала проверь след.настройки:
1. Настройка контактной зоны SQL Server - > Настройка контактной зоны для функциональных возможностей. Параметр xp_cmdshell, если выключен, то влючи.
2. Проверь стабильность сетевого подключения на серваке.
3. В релизе 5.2 выше 75 задания на обновления касс застревают, если нет активных подключений по сети. Спасает только ребут SES-служб.
У нас была такая же проблема. Оказалось все просто, на серваке был плохо обжат патчкорд (Стоял свитч Asus GigaX слишком умный, каким-то образом использовал другие пары кабеля вместо не обжатых).