Да. И даже "с нуля", если не зарегены в ЛК ФСРАР, то используя ДжаКарту можно зарегиться. Логин - Ваш ИНН, пароль вышлют на почту после регистрации. Достаточно ГОСТ сертификата, PKI не обязателен.
По логину и паролю можно будет зайти в ЛК и вообще без сертификата и какого-либо ключа, проверить марки, лицензии, почитать новости. А вот подать декларацию без сертификата или ключа уже не получится.
PS Да, маленькое уточнение - в случае ДжаКарты, выбираем вход не по сертификату, а "По ключу".