Да, перед апгрейдом до 1.024.4 будьте готовы к тому, что реестр желательно почистить ручками. Иначе службы действительно порой отказываются регистрироваться. Даже если всё встало с виду правильно, можно столкнуться с мелкими косяками, например, отказывается работать драйвер ScanPlus.NET
Сносим СМ2000, чистим реестр, ставим обратно - и всё работает.