Точно такая же проблема, в логах один в один все, сообщил в тех. поддержку атола, они утверждают что в хаб другую джакарту ставили и на нее якобы накладные пришли, что не возможно.
Посоветовали удалить лицензию и получить ее по новой, это не помогло
Пока решил вопрос через 1с розница, приняли накладные там и отправили подтверждение, поставщик успешно их принял, джакарта при этом стоит все в том же хабе)