По карточке товара. Смотреть в каких инвентаризациях участвует и идти считать. Все равно считать надо все стеллажи, где этот товар находится. Вдруг товар уже успели переместить с места на место. Не всегда все проверяется еще до начала работы магазина.
Просто, в твоем случае, если часть описей пометить как "Склад", то потом можно выбрать товар, который в описях, не помеченных, как "Склад" будет отсутствовать.