На днях в очередной раз не получилось загрузить мчд в реестр, решил поэксперементировать. Есть подпись физика Иванова на эцп 3.0 для егаис и подпись ИП Петрова на рутокен лайт. С помощью jcEmulator сформировал и сохранил RSA торговой точки ИП Петрова, импортировал этот RSA на эцп 3.0 физика Иванова, получил накладные и они успешно подтвердились, списание и запросы тоже без проблем. Проверил на других ИП, также все работает(utm_b2616). Между данным физиком и ИП-ми мчд никогда не создавались. Это конечно не решает в целом проблему с регулярными сбоями реестра мчд, но мне в данном случае помогло(нужно было срочно подтвердить накладные), т.к ИП "затупил" и выпустил подпись для егаис не на себя.
P.S Попробовал также на ООО, не работает, доки не подписываются.