Склад для производства : Супермаг Плюс (Супермаг 2000)

не увидел: производство и магазины на одном юридическом лице?

Да на одном ИП. Там вообще никакого бух. учета не ведется. Поэтому не нужно париться по поводу юр. лиц

Расчет ТД: Полный FIFO
Себестоимость: FIFO

ну раз на одном юрике - у тебя два варианта.

первый - расходы/приходы, как сразу Таня посоветовала. для разных юриков это вариант единственный.

второй - перемещения через ЦС. причем документов, реально, нифига не меньше
- приход продуктов на склад (или склад-магазин) производства
- расход на производство (пересчет продуктов в ингридиенты, списание продуктов со склада, приход ингридиентов в цех)
- акт производства
- выход из производства (списание блюд из цеха, приход на склад)
- перемещение со склада на ЦС
- перемещение с ЦС в магазины

то есть всей разницы: вместо двух документов расхода/прихода с производства на магазин будут два перемещения с производства на магазин через ЦС. только еще лишней возни огребете с учетными ценами, пока настроите и будете постоянно бодаться с зависшими на ЦС остатками, когда кто-то забыл или не смог (прав не хватило на "чужое" место хранения) правильно оформить/исправить пару одинаковых перемещений

Есть еще третий вариант.
Считать себестоимость по методу "ФиФО без МХ".
Тогда можно между магазинами делать перемещения.

Правда мне принципиально не нравится идея перемещений.
Нельзя создать перемещение, адекватно проставив в него себестоимость готовой продукции. Ну или близкое к нему значение - плановую себестоимость производства.
Как следствие, получаем проблемы с розничным ценообразованием.

Можно, конечно, перемещать по розничным ценам. Но это накладывает ограничение одной цены на все магазины. Ну и что будет, если кто-нибудь повторно этот товар наценит?