Еще раз.
Продать в розницу то, что не поставили на 3 регистр после 01.11.2020 - можно.
Для возврата поставщику можно перед возвратом привязать марки к 3 регистру (обещают, что лимитов на привязку не будет пока)
Проблема возникает со списаниями. Во всех списаниях после 01.11.2020 нужно указывать марку.
Если у вас что-то украли давным-давно, то это все нужно списать до 01.11.2020 (пока можно без указания марки).
На 01.11.2020 как минимум, надо озаботиться получением списка имеющихся в наличии старых марок (чтобы можно было потом вычислить марку, которую нужно списать).
Как максимум - привязать партии на 1 и 3 регистре. Но для корректной привязки надо долго и кропотливо разбирать бутылки по датам розлива и искать к этим бутылкам бумажные справки А, а к ним - сами поставки в ЕГАИС.