Думаю версия СМ+ тут никакого отношения ее имеет. Скорее всего вы смотрите не в ту SDB2.
1. Закройте программу.
2. Удалите папки SDB2 в папке My documents и Flash Disk
3. Запустите программу и посмотрите в где создалась папка SDB2
4. Загрузите данные из СМ+ и проверьте размер файлов
Кстати не плохо было бы знать размер файла выгруженного на ТСД супермагом.