kogkog, доп.свойства присваиваются на уровне таблиц базы Супермага и не важно откуда грузится номенклатура.
вот таблицы которые необходимо заполнить, предварительно остановить конвертер импорта:
import.signal
import.property_values
import.properties
import.item_property_values
обычно гружу скриптами, так что, свойства присваиваются за пару секунд.
если не разберешься, могу скинуть готовые скрипты.