Поднимается база с потерей индексов, данные в таблицах есть, но практически все ограничения целостности разрушены, кроме триггеров вроде. Подниаем где-нить пустую базу прогоняем генератор БД, получаем эталон.
И тут 2 варианта,
1. сливаем экспортом данные из таблиц. заливаем всё это в эталон потаблично, со временным отключением ограничений целостности, а потом валидацией индексов
2. из эталона вытаскиваем описание индексов и создаём индексы в нашем хромоногой базе, потом всё это переливаем экспортом/импортом в новую базу