Могут быть другие нюансы, дело не в одной переменной, поэтому я бы рекомендовал до понимания, что есть Linux, работать с винды. База нормальная, а остальное приложится по ходу дела.
пересоздал базу, импортировал с винды все прошло нормально но по сравнению с импортом в винду, импорт длился раз в 10 дольше, возможно связано с железом или у базы подкрутить что то нужно было...