2 юр лица в 1 магзе при см1.026сп3, укм47сп6: каталоги обмена отдельные (по 3 *2), по 3 конвертера в УКМ (имп, эксп по смене, эксп по чекам) на юр лицо\мх, конвертеры СМ2.5М использую, в "Стандартный 2 CSV импорт" тоже поле "Магазины" в конвертере импорта есть - там указывать для какого магазина в УКМе загрузка. В конвертерах экспорта по смене\чекам - номер МХ указать из СМ2к в "индекс магазина".
Версии разные, но надеюсь поможет инфа.