HyperTerminal есть, штатная программка в винде. Позволяет на COM цепляться и видеть, что там передается. В принципе, можно действительно приглядеться, что в строке выскакивает, только не всегда видно.
Но, смотри, если сам настраивал по настроечной табличке, то попробуй просто еще раз прогнать нерабочий сканер по ней. У меня было с какими-то из новых сканеров, которые появились в эпоху CheckWay, что программились раза со второго или третьего только.