И сейчас не обновляются. Планирование порядка обновления зависит от многих факторов.
В первую очередь интересно где работают конвертеры данных
(чтобы минимизировать время, когда этот обмен не происходит)
Я обычно обновляю сначала СМы с привязанными к ним кассами,
потом СГО. Конвертеры при этом работают на СМах
На ФТП инструкция старая, хотя в ней и много полезного.
Более новая инструкция:
/index.php/Обновление_версии