В заголовке чека пишется не только название юр.лица, но и адрес, ИНН и КПП магазина.
И когда у юр.лица будет несколько магазинов, то ты для каждого из них заведешь магазин в УКМ4 с указанием адреса и прочих реквизитов.
Так что, по моему мнению, "полное безобразие" где-то в другом месте.