Фронтол позволяет присваивать один штрихкод нескольким товарам.
Вероятно штрихкод сначала был выгружен из 1С для одного товара, потом для другого.
Проверьте в настройках->справочники->товары (вкладка штрихкоды) эти позиции - наверняка у них совпадают штрихкоды.
Если штрихкоды для товаров разные, тогда проверьте шаблоны в справочнике штрихкоды - возможно есть какой-то "хитрый" шаблон.