Все понял суть вопроса, точно не могу подсказать, но примерно, если у меня стоит АТОЛ: Рабочее место кассира:
1)
Б/Н - используется? если да, то обязательно указать тип оплаты код 3, в s-market будет принимать как "Продажа по кредитной карте (руб)" - зависит, как у тебя настроено ГП?
2) в Чтобы принимал файл в s-market - надо смотреть группы касс, группы мест хранение, (если нет то включить параметры в конфигураторе)
3) тоже нужно смотреть в конфигураторе - глобальные параметры - кассы - загрузка данные