Один из простейших вариантов такого вывода
Код:
grep -v '^#|^$' config.conf
вариант с большим количеством файлов (конфиг будет усечен и размещен в новом файле .new текущей директории)
Код:
#!/bin/sh
files="/home/*.conf"
for i in $files
do
grep -v '^#|^$' $i > $i.new
done