Написал обработку, и преобразовал одну из рабочих баз(пока копию, естественно). Всесторонне помучал, проблем не нашел... Да их в принципе и не должно возникнуть, в типовых механизмах конфигурации, обращение со стороны спр. Контрагенты к справочнику "ЮрЛица" идет по реквизиту ЮрФизЛицо - он на месте, какая разница, подчиненный справочник или нет? Со стороны справочника ЮрЛица, к справочнику "хозяину" идет поиском "НайтиПоРеквизиту("ЮрФизЛицо",Спр.ТекущийЭлемент(),1)". Оно как работало, так и будет работать, не важно, что этот элемент справочника Контрагенты теперь не какой-то абстрактный "хозяин"

, а его владелец. Зато теперь добавилась возможность искать Контрагента по атрибуту "Владелец", из любого подчиненного владельцу элемента(ЮрЛицо). Это развызывает руки в возможности использовать несколько обособок одного контрагента с разными КПП и ФСРАР_ID. Не знаю, почему сама 1С изначально так не сделала, так-же правильнее...
Может кому пригодится, вот:
ПреобразоватьЮрЛиц для типовой ТиС и конфигураций на ее базе.
Но, только сразу предупреждаю -
ДЛЯ ТЕХ, КТО ПОНИМАЕТ, ЧТО ЭТО ТАКОЕ! На свой страх и риск, Прежде чем что-то делать, сохраняйте копию.
Порядок действий такой:
Шаг 1. Выгружаем справочник ЮрЛица в файл. На диске С: должна быть доступная для записи папка TEMP(кнопка "Выгрузить").
Шаг 2. Очищаем ссылки на этот справочник из справочника Контрагенты(Кнопка "Очистить").
Шаг 3. Удаляем сам справочник, просто удалив дбф-ку с цд-иксом, имя файла можно посмортеть в файле с расширением .DD. Естественно, это надо делать при закрытой программе. Запускаем программу(файлы создаются сами, пустые), и убеждаемся, что ЮрЛица пропали вместе с ИНН и всеми остальными реквизитами.
Шаг 4. Подчиняем справочник ЮрЛица справочнику Контрагенты. Добавляем в модуль формы справочника контрагенты строки, как в предыдущем сообщении. Сохраняем конфигурацию.
Шаг 5. Загружаем справочник обратно из файла(он должен лежать в папке C:\TEMP\ куда был выгружен)(Кнопка "Загрузить").
Собственно и все. Получаем справочник ЮрЛица, подчиненный справочнику Контрагенты...