Лучше бы еще и на количество строк в этих таблицах ориентироваться.
В настройках почтовика есть эти искомые галки по POSTLOG. Есть и галки на срок хранения, только не всегда они работают.
Если пользуешься
оптимизатором, то почтовые таблички он чистит, SMEGAISPOSTLOG я добавлю на этих выходных. Можешь настроить и руками. А вот SMDOCLOG лучше не чистить, и хорошо бы разобраться, чего же там так много.