Извиняюсь, может не так выразился.
Ситуация 1:
Артикул есть в магазине, нет в ЦО вообще.
Для этого кнопка "локальная синхронизация"?
Ситуация 2:
Артикул совпадает, есть в магазине, есть в ЦО, но это разные товары.
Ситуация 3:
Артикулы не совпадают есть в магазине, есть в ЦО, но это один и тот же товар.
Ситуация 4:
Магазинов несколько.
Артикул совпадает, есть в магазинах, есть в ЦО, но это разные товары в каждом магазине свой.
Такие вот пироги...