Не уверен, поскольку Enlightment не использую, но подозреваю, что проблема в переходе на Wayland. Соответственно, либо у них есть вариант с возвратом на Х, либо надо искать, как переключается раскладка в Wayland, либо поставить какой-нибудь tapper.
Я пока считаю, что Wayland не готов для использования...