ArsenB, если 1С умеет, попробуйте обмениваться с фронтолом через ФТП. Я как раз обмениваюсь через фтп,
но и через папку должно работать. Возможно, что это заморочки самого яндекс диска
Ещё вспомнил, посмотрите какое имя файла ожидает фронол. Если # на @ не меняет, это значит что он не видит файл. Проверьте в настройках фронтола, какое имя он ожидает. Попробуйте без 1С просто положить файл с таким именем в папку, куда смотрит фронтол и самостоятельно закиньте файл - флаг ( без 1С, просто руками, проводником )