Выгрузка будет такой, как тебе захочется, с той детализацией которую ты захочешь... Хочешь по документам, хочешь по контрагентам, хочешь - по товарам. Загрузки в 1С универсальной не существует, её всё равно тебе самому писать придется.
Насчет + и - всё зависит от того, что ты в итоге хочешь получить.