В 1С есть такое понятие, как периодичность номера, т.е. номера могут дублироваться через заданный интервал (день, месяц, год).
Может быть, тебе выгрузили прошлогодний документ в СМ2000?
А СМ2000 этого в принципе не понимает, там поиск строго по номеру документа. Вот и получилось такое изменение?