Бывает, что почтовик ругается на несоответствие версий или сервиспаков, хотя оные совпадают.
Ситуация такая - почтовик для сравнения структур использует заранее подготовленные таблицы, в которых содержатся сведения о структуре каких-то таблиц. Соответственно, если не хочется разбираться, но есть подозрение, что в момент апгрейда схема как-то отличалась от штатной, то можно сделать следующее: сравниваем структуру с эталоном, выявляем все несоответствия и исправляем их, обращаем внимание, что штатная (в административном модуле) процедура не проверяет включенность констрейнтов, только их наличие. Все констрейнты должны быть включены! После доведения до эталона, по структуре необходимо прогнать Генератор БД заново (и накатить скрипты SP, если таковой установлен)