Достаточно долго страдал копированием файликов id_rsa.pub на рутеры Mikrotik, поскольку команды ssh-copy-id у него нет.
Однако, попалась удобная однострочная команда, которая это все делает автоматически.
Код:
ssh ПОЛЬЗОВАТЕЛЬ@192.168.88.1 -p ПОРТ "/file print file=mykey; file set mykey contents=\"`cat ~/.ssh/id_rsa.pub`\";/user ssh-keys import public-key-file=mykey.txt;/ip ssh set always-allow-password-login=yes"
Просто запустите от текущего пользователя эту команду и она скопирует все необходимое на рутер и импортнет ключ.