Я останавливаю базу перед копированием. Холодный бэкап восстанавливаю на другом серваке для отчетов. Ничего мне не мешает проверять целостность данных, запуская скрипт, хотя бы раз в неделю. Копии хрянятся за последнюю неделю, и за полгода на 1-е число каждого месяца. Работаем, правда, без единого сбоя уже 8 лет.