Если у вас есть какие то собственные приложения, которые используют запросы типа
insert into table mytable select * from supermag.smdocuments
то лучше обновляться последовательно по сервисапакам и версиям, так как от версии к версии иногда меняется последовательность полей в операторах создания таблиц(генератора БД). Если не используете, то не важно - можете накатывать сразу последнюю версию + последний сервиспак, только обязательно сделайте холодный бекап БД.