господи ... как у вас тут весело... то!
1. для начала надо попытатся выяснить что является слабым местом, для этого:
переносим 1с(каталог файловой БД) на другой комп. перенастраиваем клиентские машины на новый "сервер" - это может быть твоя рабочая станция например.
а) Она работает значительно быстрее и веселее - вывод разнести СМ и 1с по разным серверам.
б) оно тормозит также как и раньше... значит дело на в том что это на одном сервере с СМ, а в чем то еще... например можно пошаманить с настройками сети (но не на сервере а на своей рабочей машине... чтобы если что всегда можно было вернуть все в зад...
вот например почитать
https://olegon.ru/showthread.php?p=130757
2. Определятся с серверами насами и всем остальным можно\нужно тогда когда понимаешь чего и где не хватает... пока этого понимания я не вижу... Бэкап да... он должен быть... лучше в 10 местах лежать... но тут очень много нюансов... в частности если магазин сетевой и есть ЦО тут все попроще...